當史酷比一夥駕船進入世界上最神秘的海域——神奇的百慕大魔鬼三角時，恐怖事件接二連三地發生了！從被外星人監視到遇見試圖用大炮擊沉他們的幽靈海盜，離奇事件不斷湧現，令所有人膽戰心驚正當情況變得越來越糟之時，幽靈海盜綁架了弗雷德的父母，並將他的母親變成了一個海盜！倘若史酷比和薛奇無法破解這個海上之謎，那麼他們毫無疑問將成為百慕大的下一批受害者。