漁業飛行員月岡和小林在無人島上的石洞目擊哥斯拉和一隻背面長出長刺的怪獸正在打鬥。返回大阪後，二人立刻報告, 對策本部立即被成立，並查那一隻長刺的怪獸叫「安基拉斯」，又是和哥斯拉一樣受氫彈試驗而蘇醒

黑洞第三行星的人對機械哥吉拉進行改良，並且拉攏一位天才科學家真船信三博士，控制恐龍型怪獸泰坦龍來一起毀滅地球，國際刑警組織和哥吉拉將如何對付這個強大的邪惡軍團？