幕府時代末期，外憂內患，山河動盪，百姓生活困苦，且生命時刻受到威脅。少年心太因其善良純潔之心感動飛天御劍流高手比古清十郎，被其收入門下學習劍法，更名劍心。　　在國家危難之際，年輕的劍心懷揣改變時代