“闇之書事件”（參照魔法少女奈葉A’s）的10年後。踏入19歳的高町奈葉、菲特·T·哈洛溫、八神疾風三人，懷抱著彼此的友情牽絆、為了追求各自的夢想實現而加入時空管理局，並以一流魔導師的身分活躍。在此當