劇情：
千年一次的彗星之夜裡，願望將會實現……
立志成為出色的神奇寶貝訓練師的小智、小遙和小勝，帶著皮卡丘展開了新的旅程。為了觀看千年彗星出現的剎那，來到恩斯遊樂場，並認識魔術師巴特勒與戴安。在魔術表演中，小勝聽到一陣細微的呼喚聲…
那是在〝沉眠之繭〞中沉睡了千年，可幫助人類達成願望的神奇寶貝——基拉祈。在千年彗星出現的夜晚，如果遇到擁有純真心靈的夥伴便會甦醒。為了讓基拉祈醒來，巴特勒請小勝當基拉祈的夥伴，果然，基拉祈從萬花鏡般的光芒中甦醒過來。
雖然基拉祈只能停留短暫的七日就會再消失，但是頭一次擁有屬於自己的神
